Zadaniem CERT-u Narodowego będzie koordynacja działań, całodobowy monitoring, analiza i wymiana informacji. Zespół obejmie fachowców od różnych sektorów gospodarki.

CERT Narodowy zostanie zorganizowany na bazie CERT Polska (Computer Emergency Response Team), którego zadaniem jest reagowanie na zdarzenia naruszające bezpieczeństwo w Internecie. CERT Polska podlega NASK (Naukowa i Akademicka Sieć Komputerowa). CERT Narodowy stanie się częścią tworzonego Narodowego Centrum Cyberbezpieczeństwa (NCC) w ramach NASK. Ma współpracować z zespołami CERT w innych instytucjach, m.in. w MON i ABW. Koordynatorem działań między CERT-em Narodowym, MON, MSWiA i pozostałymi organizacjami będzie Ministerstwo Cyfryzacji. Nowa struktura ma rozwiązać problem braku współpracy i wymiany informacji o zagrożeniach, jak wyjaśnił wiceminister cyfryzacji Włodzimierz Nowak dla PAP. Według niego taka koordynacja jest konieczna dla szybkiego wykrywania ataków i odpowiedniego reagowania na nie.

Wiceminister poinformował także, że zostanie zorganizowany trzypoziomowy system bezpieczeństwa państwa: 1 – wczesne ostrzeganie, 2 – klastry bezpieczeństwa chroniące rejestry państwowe, 3 – zabezpieczenia w poszczególnych instytucjach. 

Z zapowiedzi ministra wynika, że za zmianami organizacyjnymi pójdą inwestycje – zwłaszcza w rozwiązania do tworzenia kopii zapasowych i archiwizowania danych w urzędach, bo wiele z nich obecnie o to nie dba.